Es ist etwa ein Jahrhundert her, dass die Menschheit begann, zu den übernatürlichen Kräften erweckt zu werden, die "Superkräfte" genannt werden. Während einige Menschen ihre Macht nutzten, um einen Beitrag zur Gesellschaft zu leisten, gibt es einige, die sie missbraucht haben, und solche, die sie nicht kontrollieren konnten.

Um auf diese Vorfälle zu reagieren, richtete der Staat das "Anti-Abnormal Unusual Talent Team (AUT)" ein, eine Strafverfolgungsbehörde, die sich aus Nutzern von Superkräften zusammensetzt. Die Zahl der Vorfälle nimmt jedoch weiter zu, so dass sie selbst für die AUT zu viel wird.

In der Zwischenzeit wurde eine spezielle Klasse "Reserve Anti Unusual Talent Team (RAUT)" unter dem Vorwand gegründet, über Kinder zu wachen und sie zu fördern, die Superkräfte erweckt haben.

Die Geschichte beginnt im Jahr 2023 mit einem ehemaligen AUT-Mitglied, das bei einem bestimmten Vorfall seine Fähigkeiten verloren hat und als verantwortlicher Lehrer für RAUT 302 eingesetzt wird.

Dem Spieler wird ein wöchentlicher Stundenplan zugewiesen, um die sieben Schüler zu entwickeln. Die "Grundwerte" wie Ausdauer und Urteilsvermögen verbessern sich je nach gewähltem Lehrplan.

Durch den Erwerb von Fähigkeiten mit zunehmenden Grundwerten beeinflussen die "Grundwerte" nicht nur den Kampf, sondern auch Live-Events in der Schule, wie z. B. regelmäßige Prüfungen.