Shin Megami Tensei IV - Im Jahr 1492 wird das östliche Königreich von Mikado durch hohe Mauern geschützt, mit der Burg und ihrem König in der Mitte. Ein junger Krieger, 18 Jahre alt, wurde gerade ausgewählt, um ein Samurai zu werden, einer, der mit Hilfe eines speziellen Werkzeugs namens Gauntlet als geheimer Beschützer der Stadt dienen wird. Es ist die Pflicht der Samurai, eine Dämonenbedrohung auszurotten, deren sich die Bürger nicht bewusst sind. Die Situation ist jedoch nicht so einfach wie die des Menschen gegenüber dem Dämon. Es gibt Fraktionen innerhalb der menschlichen Gruppe, die entdeckt und verstanden werden müssen, um Bündnisse zu bilden, Wege zu bestimmen und das Schicksal der Welt zu entscheiden.

Shin Megami Tensei IV: Finale - Die Geschichte von Shin Megami Tensei IV: Apokalypse (Shin Megami Tensei IV: Finale) zeigt die Überreste von Tokio, das von einer Katastrophe heimgesucht wurde. Dämonen und Menschen koexistieren, aber in diesem Zustand sind die Überreste der Menschheit nur ein Preis, der von den höheren Gottheiten umkämpft wird. Ein einsamer Jäger, der Protagonist des Spiels, trifft auf ein frühes Ableben und wird durch einen Pakt mit einem geringeren Gott als Gegenleistung für sein Versprechen der Knechtschaft wieder zum Leben erweckt. Von dort aus verbündet sich der Protagonist mit anderen Jägern in den Ruinen des post-apokalyptischen Tokio und beginnt eine Handlung, die mit den Ereignissen des ursprünglichen Shin Megami Tensei IV übergeht.